MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nitrosospira multiformis ATCC 25196 plasmid 2

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007616	AAC	2	6	74	79	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007616	TCCC	2	8	122	129	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_007616	CACCC	2	10	177	186	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
4	NC_007616	GTC	2	6	221	226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007616	CCT	2	6	266	271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_007616	A	8	8	307	314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007616	GCG	2	6	342	347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007616	GAA	2	6	393	398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007616	CTA	2	6	409	414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007616	CG	3	6	417	422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007616	ATA	2	6	581	586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007616	GTACT	2	10	595	604	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_007616	TAA	3	9	639	647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007616	AG	5	10	650	659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007616	AATA	2	8	2857	2864	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007616	T	8	8	2882	2889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007616	A	7	7	2984	2990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007616	AGT	2	6	3010	3015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007616	AGGT	2	8	3044	3051	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007616	AGG	2	6	3057	3062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007616	AGC	2	6	3065	3070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007616	C	6	6	3105	3110	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23	NC_007616	CTT	2	6	3175	3180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007616	ACTA	2	8	3197	3204	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_007616	AT	3	6	3262	3267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007616	GGT	2	6	4600	4605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007616	AAC	2	6	4701	4706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007616	CGT	2	6	4717	4722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007616	TGGTC	2	10	4753	4762	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_007616	GTGCT	2	10	4778	4787	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_007616	CATGCA	2	12	4788	4799	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007616	AGA	2	6	4827	4832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007616	AGGG	2	8	4850	4857	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007616	AAACAG	2	12	4971	4982	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_007616	GCAG	2	8	4991	4998	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_007616	GCCCG	2	10	5073	5082	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
37	NC_007616	CAGG	2	8	7601	7608	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_007616	CTAG	2	8	7678	7685	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_007616	GAT	2	6	7730	7735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007616	TA	3	6	8700	8705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007616	AT	3	6	8733	8738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007616	TA	3	6	8742	8747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007616	TA	3	6	8772	8777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007616	AT	3	6	8789	8794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007616	A	6	6	8828	8833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007616	GGC	2	6	8917	8922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007616	GAT	2	6	8936	8941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007616	GAGCG	2	10	8949	8958	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
49	NC_007616	TG	4	8	9011	9018	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007616	AGT	2	6	9034	9039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007616	ATG	2	6	9191	9196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007616	TGC	2	6	10299	10304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007616	GGACT	2	10	12311	12320	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_007616	CCT	2	6	12384	12389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_007616	GAG	2	6	12399	12404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007616	GGGA	2	8	12452	12459	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007616	ACTCA	2	10	12529	12538	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_007616	GCC	2	6	12643	12648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_007616	CGG	2	6	12728	12733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007616	CAG	2	6	12736	12741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007616	G	6	6	12861	12866	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007616	CTT	2	6	12993	12998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007616	GGAG	2	8	13052	13059	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007616	GCC	2	6	13161	13166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_007616	A	6	6	13170	13175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007616	TAA	2	6	13202	13207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007616	ACG	2	6	13256	13261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007616	AGCG	2	8	13301	13308	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_007616	A	8	8	16434	16441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007616	CCA	2	6	16651	16656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_007616	TA	3	6	16664	16669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007616	CAA	2	6	16684	16689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_007616	AAT	2	6	16701	16706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.